خللفي التغذية لعدة أسباب؛ إما نقص في إحدى المواد الأساسية في الطعام، أو بعضها بسبب فقر، أو جهل، أو اتباع حمية خاصة لمدة طويلة، أو عدم قدرة الجهاز الهضمي على امتصاص المقادير المناسبة من عناصره المختلفة، أو لعدم قدرة الجسم على استعمالها، أو لسبب مرض معين عادي، أو خبيث، أو أي سبب آخر.